Для обеспечения высокого качества испытаний специалисты испытательной лаборатория Алтайского филиала ФГБУ «Центр оценки качества зерна» используют процедуры управления качеством, одной из которых является внутренний аудит (проверка). Данная процедура предназначена для оценки состояния, функционирования и определения эффективности существующей системы качества в соответствии с ГОСТ ИСО/МЭК 17025-2009 «Общие требования к компетентности испытательных и калибровочных лабораторий», Приказом от 30.05.2014 г. № 326 «Об утверждении критериев аккредитации, перечня документов, подтверждающих соответствие заявителя, аккредитованного лица критериям аккредитации, и перечня документов в области стандартизации, соблюдение требований которых заявителями, аккредитованными лицами обеспечивает их соответствие критериям аккредитации и ГОСТ Р ИСО 19011-2012 «Руководящие указания по аудиту систем менеджмента».
В соответствии с утвержденным графиком внутренних аудитов на 2017 год в испытательной лаборатории ежемесячно проводятся внутренние аудиты.
За первое полугодие 2017 года в лаборатории Алтайского филиала проведены 6 внутренних аудитов, в результате которых несоответствия не выявлены.